Le gros du travail quotidien des douanes se fait aux points de passage frontaliers et concerne, principalement, les flux quotidiens de marchandises et de voyages. L'OMD en est pleinement consciente et ses activités de contrôle et de lutte contre la fraude sont destinées à fournir des outils et des instruments concrets aux fonctionnaires douaniers de première ligne, pour leur permettre de remplir leurs fonctions avec efficacité.
Les opérations visent à contrecarrer le commerce illicite, à identifier, arrêter et poursuivre les contrevenants. L'OMD apporte à ses Membres une assistance technique et une aide au renforcement des capacités, pour qu'ils puissent consolider leurs programmes de lutte contre la fraude nationaux et renforcer leur contribution aux opérations régionales et internationales de déstabilisation des groupes criminels transnationaux organisés, des contrebandiers et des organisations terroristes.
En étroite collaboration avec les Membres et le réseau des BRLR, l’OMD a coordonné et conduit des activités opérationnelles ciblant les domaines à haut risque en matière de lutte contre la fraude, à savoir l'affermissement du recouvrement des recettes, la lutte contre le trafic de stupéfiants, la santé publique et la sûreté/les DPI, la sécurité et l'environnement.